新手提示
新!
核磁共振碳谱库(nmrdata)能满足什么需要,或者解决什么问题?
如果您是从事有机化学或天然产物的研究者,一定曾为化合物的结构解析烦恼和痛苦过,nmrdata库能很好地为您解决这个难题。您仅需通过Internet远程输
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C-NMR数据,就能迅速确定已知化合物的结构,对于数据库中还没有收录的新化合物,您可以选用模糊查询或深度查试方式,得到最为相似的结构,从而为新化合物的结构确定提供重要的参考,同时避免对已知化合物进行二维核磁共振等分析。
数据库还提供化合物相关信息查询,如您计划对某个植物进行研究时,您可以用该植物的属名作为关键词进行查询,几秒种就能得到该属所有发表的化合物名称、碳谱数据及相关的文献信息。
nmrdata库不仅能帮您节省大量的研究时间,还能节约大笔的研究费用。
系统提供哪些查询,各种查询有哪些特点?
系统目前提供
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C-NMR数据查询和化合物相关信息查询两大类。
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C-NMR数据查询包括精确查询、模糊查询、深度查询、基团查询、不精确库查询;化合物相关信息查询包括化合物名称、分子式、作者、植物名称查询。
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C-NMR数据查询:
精确查询:
用以查找库中已有的化合物,查询速度快,为用户的首选查询方式。
模糊查询:
用以查找具有相似骨架的化合物。
深度查询:
用以查找具有相似骨架的化合物,用户需输入碳原子的个数。
基团查询:
针对少量碳谱数据进行查询。如用户在碳谱中发现了一个226的值,通过输入这个值,能得到包含226相似基团的化合物。基团查询一次最多允许输入6个碳原子的数值。
不精确库查询:
一些文献对于具有长链CH2的化合物,没有精确归属碳谱值,给出的仅是一个范围。对于这些化合物,我们建立了一个不精确碳库数据库。其查询方法,和其他相似,您仅需将能够识别出的碳谱数值由小至大输入即可。本库也收录了少量的具有多数OAc基团的化合物(给出的也是范围值)。
化合物相关信息查询:
化合物名称查询:
对化合物的名称进行查询,如果同时存在系统名和俗名的化合物,请以俗名进行查询。
分子式查询:
对化合物的分子式进行查询。
作者查询:
以文献的作者作为关键词进行查询。
植物名称查询:
对植物的属名或种名进行查询,命名人不用输入。
如何输入
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C NMR数据?
请按由小至大的顺序输入
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C NMR数据,数据保留小数点1位或2位,数据间用英文逗号(半角状态下)隔开,最后一位数字后不用加任何符号。
如:21.4,30.4,37.4,73.2,73.7,125.6,126.6,139.6,140.2,168.2
如何选择溶剂?
您可以选择测试
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C-NMR的溶剂,我们在下拉列表框中列出了NMRDBS库中常用的一些溶剂。
由于我们对算法进行了多次改进,几秒钟内就能完成一次模糊查询。少量文献中,作者没有列出溶剂,为了避免漏查,建议用户采用系统默认值,对所有溶剂进行查询。
如何选择配匹容差?
系统默认精确查询匹配容差为0.5,
模糊查询
、
深度查询
、
基团查询
的匹配容差为1,如果您得不到相似的结构,您可以加大匹配容差,建议不要大于3。
匹配容差的值越大,查到的化合物数量会越多。
模糊查询和深度查询有什么区别?
模糊查询和深度查询都用以查找具有相似结构的化合物。
在设计模糊查询时,为了提高查询速度,我们做了一些筛选,可能部分基有相似结构的化合物被剔除了。为此我们设计了深度查询,对模糊查询的缺陷进行弥补。
五种
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C NMR查询的最佳顺序是什么?
建议用户查询的顺序为:精确查询>模糊查询>深度查询;
如果化合物有较长的CH2侧链,请用模糊查询或不精确库查询;
如果对个别碳谱值拿不准,请用基团查询。